A área de fiscalização da Conab foi criada em 1994 e configura-se em um instrumento valioso para a formação, manutenção e garantia da integridade dos estoques públicos, além da avaliação dos instrumentos de apoio à comercialização agrícola, das políticas públicas e dos programas e ações executados pela Conab.

Cabe à fiscalização da Conab coordenar a fiscalização dos estoques, promover a classificação e o controle de qualidade de produtos alimentícios, efetuar a supervisão técnico-operacional das ações provenientes dos instrumentos de escoamento dos estoques públicos e/ou privados, realizar a fiscalização dos programas institucionais e sociais de abastecimento, repassar às áreas competentes as informações dos resultados obtidos.